وہ اصلی اور پیپٹائڈس کے مابین رابطے کے ذریعہ دو یا زیادہ امینو ایسڈ کے اتحاد کی نمائندگی کرتے ہیں ۔ مصنوعات اور پروٹینوں میں ، یہ بانڈ پیپٹائڈ بانڈ سے متعلق ہیں اور پانی کے انو کے خاتمے کے ساتھ ، دوسرے کے امینو گروپ کے ساتھ ، کاربوکسائل گروپ کے رد عمل کا نتیجہ ہیں۔
پیپٹائڈ بانڈ (-CO-NH-) عام طور پر ایک سنگل بانڈ کے طور پر ظاہر کیا جاتا ہے. بہر حال ، اس میں متعدد خصوصیات ہیں جو لگ بھگ ڈبل بانڈ کی حیثیت سے ہیں۔ چونکہ نائٹروجن آکسیجن کے مقابلے میں کم برقی ہے ، لہذا سی او بانڈ میں 60 double ڈبل بانڈ کا کردار ہے جبکہ CN بانڈ 40٪ ہے۔ لہذا ، پیپٹائڈ بانڈ کے CO اور NC بانڈوں میں سنگل بانڈ اور ڈبل بانڈ کے درمیان انٹرمیڈیٹ خصوصیات ہیں۔ در حقیقت ، سی او اور سی این بانڈز میں ماپا جانے والا انٹراٹومیٹک فاصلہ واحد کنکشن اور ڈبل بانڈ کے بیچ بیچ ہوتے ہیں۔ یہ ایٹم انتظام کی طرف سے مستحکم ہے گونج، تاکہ پیپٹائڈ بانڈ کی تشکیل میں شامل چھ جوہری اسی طیارے میں شامل ہوں۔
گونج کا ایک اور اہم نتیجہ یہ ہے کہ اس سے پیپٹائڈ بانڈ کی واضحیت میں اضافہ ہوتا ہے اور ایک ڈوپول لمحہ (اوپر ٹیبل میں دائیں شخصیت) قائم ہوتا ہے۔ اس وجہ سے ، ہر پیپٹائڈ بانڈ دو ہائیڈروجن بانڈ میں حصہ لے سکتا ہے۔ ان میں سے ایک میں ، NN- گروپ ہائیڈروجن ڈونر کی حیثیت سے کام کرتا ہے اور دوسرے میں ، -CO- گروپ ہائیڈروجن ریسیپٹر کے طور پر کام کرتا ہے۔ یہ خاصیت پروٹین کے تین جہتی فولڈنگ میں نمایاں حصہ ڈالتی ہے ، جیسا کہ ہم بعد میں دیکھیں گے۔
جزوی نوعیت ڈبل بانڈ کے پیپٹائڈ بانڈ میں C اور ن ایٹموں میں شامل ہو جاتا ہے کہ بانڈ کے مفت گردش روکتا ہے. ڈبل بانڈ کی یہ سختی پیپٹائڈس کے تعمیری امکانات کو محدود کرتی ہے۔ دو ممکنہ ترتیب موجود ہیں:
- سی آئی ایس کنفیگریشن: دو سی اےز ڈبل بانڈ کے ایک ہی طرف ہیں۔
- ٹرانس کی تشکیل: دو Ca's ڈبل بانڈ کے مختلف رخ پر ہیں۔
یہ واضح رہے کہ ، عام طور پر ، پیپٹائڈ بانڈ کو ایک بانڈ کے طور پر پیش کیا جاتا ہے ۔ کسی بھی معاملے میں ، اس میں متعدد خصوصیات ہیں جو اسے دوہرے بانڈ کے قریب کرتی ہیں۔ اسی لئے ماہرین عام طور پر یہ ذکر کرتے ہیں کہ پیپٹائڈ بانڈ میں ایسی خصوصیات ہوتی ہیں جو اسے ایک بانڈ اور ڈبل بانڈ کے درمیان آدھے راستے پر رکھ دیتی ہیں۔
